Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms