Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms