Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms