Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms