Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LCORQ96JN0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms