Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms