Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms