Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms