Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EXOSC8Q96B26 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms