Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms