Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms