Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms