Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms