Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms