Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms