Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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