Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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