Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UFSP1Q6NVU6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UFSP1Q6NVU6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms