Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF123Q5XPI4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms