Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms