Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms