Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms