Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GARNL3Q5VVW2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms