Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms