Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms