Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms