Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms