Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED5Q49AG3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms