Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms