Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
QSER1Q2KHR3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
QSER1Q2KHR3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms