Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA3Q16787 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA3Q16787 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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