Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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