Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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