Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SYCP1Q15431 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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