Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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