Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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