Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms