Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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