Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL9A3Q14050 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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