Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGA9Q13797 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA9Q13797 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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