Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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