Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms