Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSRP1Q08945 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms