Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms