Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms