Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms