Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms