Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms