Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms