Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms